The investigation of the interactions between functionalized AuNPs and nucleic acids is crucial for the development of novel receptors used for diagnostics. In this study, the interaction between three different AuNPs and ds/ssDNA of different lengths has been evaluated through fluorimetry and DLS. The fluorimetry analysis shows that the affinity between the AuNPs and the nucleic acids reflects the nature of the functional groups on the AuNPs. Furthermore, longer ssDNA sequences show a greater affinity towards AuNPs because of cooperativity, and ssDNA shows a greater affinity compared to dsDNA due to a greater flexibility of the chain and a major exposure of phosphate groups. The DLS analysis shows that the interaction between AuNPs and nucleic acids forms aggregates that resemble a histon-like conformation.

L'investigazione delle interazioni tra AuNPs funzionalizzate e acidi nucleici è cruciale per lo sviluppo di recettori innovativi usati per la diagnostica. In questo studio, l'interazione tra AuNPs funzionalizzate e ds/ssDNA di diverse lunghezze è stata valutata tramite fluorimetria e DLS. L'analisi fluorimetrica mostra che l'affinità tra le AuNPs e gli acidi nucleici riflette la natura dei gruppi funzionali sulle AuNPs. Inoltre, sequenze di ssDNA più lunghe mostrano una affinità maggiore verso le AuNPs a causa della cooperatività, e il ssDNA mostra un'affinità maggiore rispetto al dsDNA a causa di una maggiore flessibilità della catena e una maggiore esposizione dei gruppi fosfato. L'analisi al DLS mostra che l'interazione tra le AuNPs e gli acidi nucleici forma aggregati che ricordano una conformazione simile a quella degli istoni.

Studi di affinità tra AuNPs funzionalizzate e DNA

CROZZOLIN, ANDREA
2024/2025

Abstract

The investigation of the interactions between functionalized AuNPs and nucleic acids is crucial for the development of novel receptors used for diagnostics. In this study, the interaction between three different AuNPs and ds/ssDNA of different lengths has been evaluated through fluorimetry and DLS. The fluorimetry analysis shows that the affinity between the AuNPs and the nucleic acids reflects the nature of the functional groups on the AuNPs. Furthermore, longer ssDNA sequences show a greater affinity towards AuNPs because of cooperativity, and ssDNA shows a greater affinity compared to dsDNA due to a greater flexibility of the chain and a major exposure of phosphate groups. The DLS analysis shows that the interaction between AuNPs and nucleic acids forms aggregates that resemble a histon-like conformation.
2024
Affinity studies between functionalized AuNPs and DNA
L'investigazione delle interazioni tra AuNPs funzionalizzate e acidi nucleici è cruciale per lo sviluppo di recettori innovativi usati per la diagnostica. In questo studio, l'interazione tra AuNPs funzionalizzate e ds/ssDNA di diverse lunghezze è stata valutata tramite fluorimetria e DLS. L'analisi fluorimetrica mostra che l'affinità tra le AuNPs e gli acidi nucleici riflette la natura dei gruppi funzionali sulle AuNPs. Inoltre, sequenze di ssDNA più lunghe mostrano una affinità maggiore verso le AuNPs a causa della cooperatività, e il ssDNA mostra un'affinità maggiore rispetto al dsDNA a causa di una maggiore flessibilità della catena e una maggiore esposizione dei gruppi fosfato. L'analisi al DLS mostra che l'interazione tra le AuNPs e gli acidi nucleici forma aggregati che ricordano una conformazione simile a quella degli istoni.
AuNPs
gold nanoparticles
DNA
Affinity
nucleic acids
File in questo prodotto:
File Dimensione Formato  
Andrea Crozzolin Tesi LM.pdf

accesso aperto

Dimensione 2.81 MB
Formato Adobe PDF
2.81 MB Adobe PDF Visualizza/Apri

The text of this website © Università degli studi di Padova. Full Text are published under a non-exclusive license. Metadata are under a CC0 License

Utilizza questo identificativo per citare o creare un link a questo documento: https://hdl.handle.net/20.500.12608/89734