Approcci molecolari per la tracciabilità della cultivar di frumento Senatore Cappelli

The aim of this thesis was to develop a molecular approach for the traceability of the wheat cultivar T. turgidum ssp. durum cv. Senator Cappelli. To this aim, genomic DNA was extracted by the automated BioSprint96 platform (Qiagen) from plants belonging to 20 wheat cultivars. The DNA analysis involved ascertaining the allelic status of 6 molecular markers SNP (Single Nucleotide Polymorphism) using Sanger sequencing, HRM analysis (High Resolution Melting, Thermo Fisher), and rhAmp allelic discrimination assays (IDT). The results allowed the identification of two molecular SNP markers (TRI_BIOM_4 and TRI_BIOM_6) able of discriminating the Senatore Cappelli wheat cultivar from other cultivars. These two molecular SNP markers and their associated allelic discrimination assays can be used for traceability of the Senatore Cappelli cultivar along the food chain.

Lo scopo di questo lavoro di tesi è stato quello di mettere a punto un approccio molecolare per la tracciabilità della cultivar di frumento T. turgidum ssp. durum cv. Senatore Cappelli. A tal fine, il DNA genomico è stato estratto mediante la piattaforma automatizzata BioSprint96 (Qiagen) da piante appartenenti a 20 cultivar di frumento. L’analisi del DNA ha riguardato l’accertamento dello stato allelico di 6 marcatori molecolari SNP (Single Nucleotide Polymorphism) utilizzando il sequenziamento Sanger, l’analisi HRM (High Resolution Melting, Thermo Fisher) e saggi di discriminazione allelica rhAmp (IDT). I risultati hanno permesso di identificare due marcatori molecolari SNP (TRI_BIOM_4 e TRI_BIOM_6) in grado di discriminare la cultivar di frumento Senatore Cappelli dalle altre cultivar. Questi due marcatori molecolari SNP e i rispettivi saggi di discriminazione allelica ad essi associati potranno essere utilizzati per la tracciabilità della cultivar Senatore Cappelli lungo la filiera alimentare.