Flavescence dorée (FD) is a quarantine disease in Europe, which causes significant production damage to grapevines and whose severity depends on varietal susceptibility. The causal agent is represented by phytoplasmas, transmitted from vine to vine by the insect Scaphoideus titanus Ball, a leafhopper of Nearctic origin, strictly ampelophagous, which completes its entire biological cycle in the vineyard. FD phytoplasmas, in addition to the grapevine and the vector, can also be found in other species of leafhoppers and spontaneous and cultivated plants; there are several variants, so studying the strains of these pathogens can help to understand the epidemiology of the disease. The objective of this thesis was to characterize the strains present in S. titanus captured in vineyards in Veneto. By collecting 100 samples of S. titanus from 4 vineyards selected for the high incidence of the disease, and subsequently extracting their DNA, the possible presence of FD phytoplasmas was initially verified by Realtime PCR analysis, and the identified strains were subsequently characterized, thanks to molecular analyses of direct and nested PCR and sequencing of positive samples. The results obtained confirmed that in the vineyards of Veneto the M54 strain is the one most involved in the epidemiology of FD through its vector S. titanus.

La Flavescenza dorata (FD) è una malattia di quarantena in Europa, che causa importanti danni produttivi alla vite e la cui gravità dipende dalla suscettibilità varietale. L’agente causale è rappresentato da fitoplasmi, trasmessi da vite a vite dall’insetto Scaphoideus titanus Ball, cicalina di origine neartica, strettamente ampelofaga, che compie l’intero ciclo biologico in vigneto. I fitoplasmi della FD, oltre che nella vite e nel vettore, si possono riscontrare anche in altre specie di cicadellidi e di piante spontanee e coltivate; ne esistono diverse varianti, per cui studiare i ceppi di questi patogeni può aiutare a capire l’epidemiologia della malattia. Nella presente tesi ci si è posti come obiettivo la caratterizzazione dei ceppi presenti in S. titanus catturati all’interno di vigneti del Veneto. Attraverso la raccolta di 100 campioni di S. titanus su 4 vigneti selezionati per l’alta incidenza della malattia, e la successiva estrazione del loro DNA, si è inizialmente verificata l’eventuale presenza dei fitoplasmi della FD tramite analisi Realtime PCR, e successivamente si sono caratterizzati i ceppi individuati, grazie ad analisi molecolari di PCR diretta e nested ed al sequenziamento dei campioni positivi. I risultati ottenuti hanno confermato che nei vigneti del Veneto il ceppo M54 è quello maggiormente coinvolto nell’epidemiologia della FD tramite il suo vettore S. titanus.

Caratterizzazione molecolare dei fitoplasmi della Flavescenza dorata in Scaphoideus titanus raccolti in vigneti veneti

BENETTI, VIRGINIA
2023/2024

Abstract

Flavescence dorée (FD) is a quarantine disease in Europe, which causes significant production damage to grapevines and whose severity depends on varietal susceptibility. The causal agent is represented by phytoplasmas, transmitted from vine to vine by the insect Scaphoideus titanus Ball, a leafhopper of Nearctic origin, strictly ampelophagous, which completes its entire biological cycle in the vineyard. FD phytoplasmas, in addition to the grapevine and the vector, can also be found in other species of leafhoppers and spontaneous and cultivated plants; there are several variants, so studying the strains of these pathogens can help to understand the epidemiology of the disease. The objective of this thesis was to characterize the strains present in S. titanus captured in vineyards in Veneto. By collecting 100 samples of S. titanus from 4 vineyards selected for the high incidence of the disease, and subsequently extracting their DNA, the possible presence of FD phytoplasmas was initially verified by Realtime PCR analysis, and the identified strains were subsequently characterized, thanks to molecular analyses of direct and nested PCR and sequencing of positive samples. The results obtained confirmed that in the vineyards of Veneto the M54 strain is the one most involved in the epidemiology of FD through its vector S. titanus.
2023
Molecular characterization of Flavescence dorée phytoplasmas in Scaphoideus titanus collected in Veneto vineyards
La Flavescenza dorata (FD) è una malattia di quarantena in Europa, che causa importanti danni produttivi alla vite e la cui gravità dipende dalla suscettibilità varietale. L’agente causale è rappresentato da fitoplasmi, trasmessi da vite a vite dall’insetto Scaphoideus titanus Ball, cicalina di origine neartica, strettamente ampelofaga, che compie l’intero ciclo biologico in vigneto. I fitoplasmi della FD, oltre che nella vite e nel vettore, si possono riscontrare anche in altre specie di cicadellidi e di piante spontanee e coltivate; ne esistono diverse varianti, per cui studiare i ceppi di questi patogeni può aiutare a capire l’epidemiologia della malattia. Nella presente tesi ci si è posti come obiettivo la caratterizzazione dei ceppi presenti in S. titanus catturati all’interno di vigneti del Veneto. Attraverso la raccolta di 100 campioni di S. titanus su 4 vigneti selezionati per l’alta incidenza della malattia, e la successiva estrazione del loro DNA, si è inizialmente verificata l’eventuale presenza dei fitoplasmi della FD tramite analisi Realtime PCR, e successivamente si sono caratterizzati i ceppi individuati, grazie ad analisi molecolari di PCR diretta e nested ed al sequenziamento dei campioni positivi. I risultati ottenuti hanno confermato che nei vigneti del Veneto il ceppo M54 è quello maggiormente coinvolto nell’epidemiologia della FD tramite il suo vettore S. titanus.
Flavescenza dorata
Scaphoideus titanus
Vigneti
Fitoplasmi
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